Фамилия Тохтабакиев, скорее всего, ведет происхождение от восточного имени Тохтабак. Оно восходит к тюркским словам «токътау» - «остановиться, перебой» и «бак» - «князь». Согласно другой версии, фамилия Тохтабакиев происходит от топонима. Корни ее находятся в Крыму, где на побережье залива Сиваш находилась деревня Тохтаба (ныне - село Лиманка Советского района). Вероятно, предок-основатель фамилии Тохтабакиевых относился к крымским татарам и жил в этих местах. Среди представителей однокоренных фамилий известен Тохтабаков Турбаки (1918-1941) - стрелок 121-й стрелковой дивизии 45-го стрелкового корпуса (1-го формирования) 13-й армии Центрального фронта (1-го формирования), красноармеец.