Фамилия Токтошева образована от мужского имени Токтош — тюркского по происхождению, распространённого у киргизов, алтайцев и других народов Центральной Азии. Основа имени — глагольная форма «токто-» (останавливаться, задерживаться, успокаиваться), а суффикс «-ш» придаёт значение деятеля или обладателя признака. Таким образом, Токтош — это «тот, кто останавливает», «устойчивый», «спокойный» или даже «ребёнок, родившийся после долгого перерыва» (в родильной магии многих тюркских народов имя давали, чтобы «остановить» череду смертей или неудач).

Словообразовательная модель проста: к основе Токтош добавили русский патронимический суффикс -ев (фонетический вариант -ов после шипящего), а затем женское окончание -а. В русской традиции фамилии на -ев/-ов фиксировали принадлежность к роду: Токтошева — «дочь или жена человека по имени Токтош». Мужской вариант — Токтошев.

Географически фамилия привязана к Кыргызстану, южным регионам Алтая и, реже, к татаро-башкирской среде. В России её носители чаще всего встречаются в Омской области, на Алтае и в Москве — как результат миграции из Средней Азии в XX веке. Интересно, что у алтайцев имя Токтош могло быть не личным, а прозвищным — так называли медлительного или упрямого человека, и фамилия тогда фиксировала не родовое имя, а характеристику первого носителя.

Сравнение с однокоренными фамилиями — Токтаров, Токтамышев, Токтогулов — показывает, что все они восходят к разным глагольным формам от той же основы «токта-/токто-» (останавливаться). Токтошева выделяется уменьшительно-ласкательным суффиксом -ш, который в тюркских языках часто давал именам фамильярный или детский оттенок. То есть Токтош — это не полное имя, а скорее домашнее, внутрисемейное обращение, которое со временем закрепилось как официальная фамилия.

В архивных записях XIX века фамилия практически не встречается — это говорит о её сравнительно позднем оформлении, вероятно, уже в советский период, когда паспортизация массово переводила тюркские имена в русскую фамильную форму. Сословной принадлежности предков по фамилии не установить: носители могли быть и скотоводами, и ремесленниками, и крестьянами.