Фамилия Томбу — редкий случай в русском ономастиконе, и её происхождение, скорее всего, не связано с привычной моделью «отчество + суффикс». В русском языке фамилии на -у (-ю) почти не встречаются в исконном пласте: они характерны для украинской, молдавской или тюркской традиции. Сама основа Томбу не имеет очевидных славянских корней, поэтому главная версия — заимствованная.

Наиболее вероятное объяснение ведёт к тюркским языкам. В них слово «томбу» (или «томбак», «дөмбө») означает «круглый», «пухлый», «надутый» — так могли прозвать полного человека или того, кто ходил с важным, надутым видом. В турецком и крымскотатарском «tombul» — «толстяк», «пухляш». В казахском «дөңбек» — «круглый камень» или «бугор». Фамилия могла попасть в русскую среду через контакты с тюркскими народами Поволжья, Крыма или Кавказа. Интересно, что в некоторых тюркских диалектах «томбу» — это ещё и название небольшого бубна или барабана, что делает возможным прозвище музыканта.

Другая, менее вероятная версия — молдавское или румынское происхождение. В румынском «tombă» — «могила» (от славянского «гроб»), но это слово редкое и скорее дало бы фамилию Томбэ. Если фамилия встречается в Бессарабии (современная Молдова), можно предположить, что её принесли гагаузы или болгары, у которых тоже есть схожие звучания.

С точки зрения словообразования, фамилия Томбу не получила русского суффикса -ов или -ин, что указывает на позднюю фиксацию или на то, что её носители долго сохраняли исходную форму. В дореволюционных списках такая фамилия почти не встречается, что подтверждает её локальный характер. Сейчас Томбу можно встретить в Краснодарском крае, в Крыму и у русских, выехавших из Средней Азии.

Если отбросить экзотические гипотезы, остаётся одно: фамилия Томбу — это прозвище по внешности (толстяк) или по ремеслу (барабанщик), закреплённое без изменений. Её редкость — не повод для догадок, а прямое указание на то, что предки были выходцами из тюркской или степной среды.