Фамилия Томоян — яркий пример армянской модели фамилии, образованной с помощью патронимического суффикса -ян. Этот суффикс, восходящий к древнеармянскому -янц, означает «из рода» или «принадлежащий к», то есть Томоян буквально переводится как «сын Томо» или «потомок Томо». Основа фамилии — личное имя Томо, которое является армянской краткой формой от библейского имени Фома (аналог русского Фома). В армянской традиции имя Фома (Товмас) сокращалось до Томо, и от этой уменьшительной формы и пошла фамилия.

В отличие от русских фамилий, которые часто закрепляли за крестьянами после отмены крепостного права, армянские фамилии на -ян формировались раньше, в основном в среде ремесленников, купцов и духовенства. Томоян — не исключение: предки носителя этой фамилии, скорее всего, жили в исторической Восточной Армении (территория современных Армении, Нагорного Карабаха, частично Грузии и Азербайджана). Встречаются также варианты написания Томоянц (с сохранением более древнего суффикса -янц) и Томоян — это одна и та же фамилия в разных диалектах.

Интересная деталь: в русском языке фамилию Томоян не склоняют, если она принадлежит женщине, а мужской вариант склоняется по правилам армянских фамилий (Томояна, Томояну). Поскольку имя-основа Томо не имеет прямого отношения к ремеслу или прозвищу, фамилия чисто патронимическая — она указывает на родство с человеком по имени Томо, а не на занятие или внешность предка. Встречаются и однокоренные фамилии вроде Томосян, Томасян, Томян — все они восходят к тому же корню, но с разными суффиксами или вариантами произношения.