Фамилия Топоркина — женская форма фамилии Топоркин, которая образована не от топора как орудия, а от прозвища Топорок. В русской ономастике это не такой редкий случай: слово «топорок» в разных говорах имело несколько значений. В северных и сибирских диалектах топорком называли небольшую птицу из семейства чистиковых (родственника тупика), а также — в переносном смысле — человека с грубоватым, рубленым лицом или, наоборот, крепкого, коренастого. Но самая вероятная версия связана с ремеслом: топорком на Руси называли бондаря, который делал кадки и бочки, используя специальный топорик-топорок. То есть предок носителя фамилии мог быть бочаром.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Топоркин — «сын Топорка». Модель типична для русских фамилий, образованных от прозвищ или нецерковных имён на -а/-я (Топорок → Топорка → Топоркин). Встречается она в основном в центральной России и Поволжье, хотя точная география бытования размыта — фамилия не слишком частая.

Стоит отметить, что фамилию Топоркина могли получить и от названия деревни Топорки (такие встречаются в Костромской и Вятской губерниях), но в таком случае ожидалась бы форма на -ский (Топорковский). Поэтому прозвищное происхождение надёжнее. В словаре Веселовского «Ономастикон» есть упоминание Топорка как личного имени-прозвища в XVI веке, что подтверждает древность этой модели.