Фамилия Тойганова — женская форма фамилии Тойганов. Её основа, скорее всего, восходит к тюркскому имени или прозвищу Тойган. В тюркских языках, например в татарском, башкирском или казахском, слово «той» означает «праздник, пир», а аффикс «-ган» образует причастие или имя деятеля. Таким образом, «Тойган» можно перевести как «тот, кто устроил пир» или «рождённый на празднике». В тюркской ономастике такие имена давали детям, появившимся на свет в день большого торжества, или же людям, известным своим гостеприимством и склонностью к застольям.

Модель образования фамилии — патронимическая, но нестандартная для русского уха. Суффикс «-ов» (в женском варианте «-ова») присоединён к основе «Тойган», что характерно для фамилий, возникших в среде крещёных тюркских народов Поволжья и Урала, а также для русских фамилий, записанных по тюркскому корню. В отличие от фамилий на «-ин», которые чаще образуются от основ на -а/-я, здесь сработала модель, типичная для русификации тюркских имён: к полной форме имени добавили русский суффикс принадлежности.

Географически фамилия Тойганова наиболее вероятно связана с Татарстаном, Башкортостаном, Оренбургской областью или другими регионами, где исторически жили тюркские народы. Встречается она относительно редко, что говорит о локальном происхождении — возможно, от конкретного рода или селения. В дореволюционных источниках фамилия могла писаться с вариациями: Тайганов, Тойганов, что связано с диалектным произношением и особенностями записи в метрических книгах.

Если рассматривать социальный контекст, то носители фамилии Тойгановы, скорее всего, происходили из крестьян или мещан, принявших православие и получивших фамилию по имени предка. В тюркской среде фамилии на «-ов» нередко давали при переходе в русское подданство или при записи в ревизские сказки. Таким образом, за фамилией стоит не ремесло или прозвище, а личное имя, которое несло в себе пожелание радости и изобилия.