Фамилия Трахоньков — редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. Чтобы понять, откуда она взялась, нужно разобрать её по частям и заглянуть в прошлое, где прозвища часто были хлёсткими и точными.

Основа фамилии — «Трахоньк-». Это не полное имя, а, скорее всего, прозвище, образованное от глагола «трахнуть» или существительного «трах». В старых русских говорах у этого слова был широкий спектр значений: от «ударить, стукнуть» до «грохнуть, упасть с шумом». Человек мог получить такое прозвище за шумный нрав, неуклюжесть или, наоборот, за силу и резкость движений. В некоторых диалектах «трах» означало также «внезапный испуг» или «гром». Слово было скорее просторечным, чем литературным, что указывает на низовое, народное происхождение.

Суффикс «-оньк-» здесь — уменьшительно-ласкательный или, точнее, пренебрежительно-уменьшительный. В русских фамилиях он встречается нечасто (сравните с фамилиями на «-еньк-» или «-онк-», типичными для украинской традиции). В данном случае «Трахонька» — это либо ласкательное обращение к человеку по прозвищу Трах, либо форма, закрепившаяся за его сыном. Дальше стандартный суффикс «-ов» превратил прозвище в фамилию, отвечающую на вопрос «чей?»: «сын Трахоньки».

Географически фамилия Трахоньков — явно не столичная и не дворянская. Она тяготеет к южнорусским и, возможно, украинским областям, где фамилии на «-оньк-» встречаются чаще. В дореволюционных списках и современных базах данных она крайне редка, что говорит о её локальном бытовании — в одной или нескольких соседних деревнях. Предки носителя этой фамилии, скорее всего, были крестьянами или ремесленниками, и прозвище закрепилось за их родом из-за яркой черты характера или поведения первого Трахоньки.

Если рассматривать альтернативную версию, иногда фамилию связывают с диалектным словом «трахонь» (старая, ветхая вещь или хлам). Но такая версия менее убедительна: прозвища от глаголов действия встречаются в ономастике намного чаще, чем от названий предметов с неясной семантикой. Таким образом, Трахоньков — это фамилия-характеристика, образованная от меткого народного прозвища, которое могло означать «громкий», «шумный» или «резкий» человек.