Фамилия Трубчанинов звучит как отчество второго порядка: она отвечает на вопрос «чей?» и означает «сын Трубчанина», а тот, в свою очередь, — сын или внук человека с прозвищем Трубчанин. Такая модель с суффиксом -инов характерна для фамилий, образованных от прозвищ и имен, оканчивающихся на -а/-я, и в этом смысле Трубчанинов стоит в одном ряду с фамилиями типа Сытин или Путятин.

Главная версия происхождения — географическая. Прозвище Трубчанин давали жителю города Трубчевска (в старину — Трубецк, Трубческ), что на Брянщине. Этот город долго находился во владении князей Трубецких, и прозвище могло закрепиться за выходцем из этих мест, который перебрался в другие земли. Такой способ именования — по прежнему месту жительства — был очень распространён на Руси: так появлялись Тверитиновы, Москвитиновы, Рязанцовы. В этом случае фамилия Трубчанинов — дальняя родня княжеской фамилии Трубецких, но не по крови, а по общему «малому корню» — названию города.

Есть и вторая, менее правдоподобная версия, которая выводит фамилию из прозвища Трубчанник. Если следовать ей, то перед нами «профессиональное» именование: трубчанником называли трубача, позже — трубочиста, а в XIX веке так могли сказать про пожарного, который трубил в трубу при выезде команды. Соблазн принять эту версию велик, ведь она делает фамилию «ремесленной», но лингвистически она слабее: суффикс -анин в основе (Трубчанин) чётко указывает на принадлежность к месту, а не к занятию. Форма Трубчанник с двойным -нн- в прозвищной среде встречалась реже, и переход Трубчанников → Трубчанинов маловероятен.

Историческая география фамилии тоже говорит в пользу «городской» версии. Трубчевск — один из древнейших городов Чернигово-Северской земли, и его жители, переселяясь на север и восток, в московские и рязанские земли, уносили с собой прозвище по родному городу. В писцовых книгах XVI–XVII веков такие прозвища быстро превращались в фамилии, потому что закреплялись за детьми и внуками переселенца.

В итоге наиболее вероятно, что предок носителя фамилии Трубчанинов был уроженцем Трубчевска или его округи. Фамилия редкая, и это как раз тот случай, когда прозвище не растворилось в массе однотипных именований, а сохранило память о конкретном городе на Десне.