Фамилия Трухницкая звучит довольно редко, и её происхождение не лежит на поверхности. Чтобы понять, откуда она взялась, стоит в первую очередь обратить внимание на суффикс. Форма на -ский/-цкий в женском роде (Трухницкая) и мужском (Трухницкий) указывает на географическое происхождение. Такую фамилию обычно получали люди, владевшие землей или жившие в месте с названием Трухница, Трухничи или похожим. В польской, украинской и белорусской традиции суффикс -цкий был типичен для шляхты, но в России он мог закрепиться за выходцами из духовенства, которые брали фамилии по названиям своих приходов.

Основа фамилии — «Трухн-» — скорее всего, восходит к прозвищу Трухна. Это могла быть народная форма церковного имени Трифон (через сокращение «Трух» и добавление уменьшительного суффикса). Имя Трифон в переводе с греческого означает «живущий в роскоши» или «нежный», но в быту оно нередко ассоциировалось с крестьянским трудом. Однако есть и другая, более прозаичная версия: слово «труха» (трухлявый, гнилой) могло стать основой для прозвища человека, например, дряхлого старика или того, кто занимался переработкой льняной тресты (трухи). В говорах «трухнуть» означало «ветшать», «рассыпаться», что тоже могло дать фамильное прозвище.

Если принять версию о географическом происхождении, то фамилия Трухницкий/Трухницкая могла возникнуть в западных губерниях Российской империи — на территории современной Беларуси или Украины. Топоним Трухница или Трухничи встречается в старых польских метриках и картах. В этом случае носитель фамилии — либо потомок местного помещика, либо (что вероятнее для России) священник, получивший фамилию по названию села, где стояла его церковь.

Таким образом, Трухницкая — фамилия с двойным дном. Внешне она выглядит как «шляхетская» или «семинарская», но её корень может уходить в бытовое прозвище, связанное с ветхостью или обработкой льна. Однозначного ответа здесь нет, и каждая из версий имеет право на существование.