Фамилия Трушагин — одна из тех, где на первый взгляд лежит простое слово, а при ближайшем рассмотрении открывается несколько разных тропинок. Скорее всего, её основа — не глагол «трусить» (бояться), а древнерусское прозвище или имя.

Разберём словообразовательную модель. Суффикс -ин указывает на принадлежность: Трушагин — сын Трушаги. Сама основа Трушаг- — это, вероятно, форма от имени Труш или Труша. В русской ономастике известны некалендарные имена Труш, Труша. Они могли происходить от слова «трус» в старом значении — не «боязливый», а «землетрясение», «колебание», «сотрясение». В говорах «трусить» означало «трясти», «сыпать», «дрожать». Прозвище Труша могли дать человеку суетливому, торопливому или, наоборот, крепкому, от которого «земля трясётся».

Другая версия, не менее правдоподобная, — диалектная. В северных и вятских говорах «труша» — это мелкий дождь, изморось, а также труха, крошево. Прозвище могло закрепиться за невысоким, щуплым человеком или за тем, кто занимался размолом зерна, «трушил» муку. Ещё одно значение — «трухать» (ехать рысью, трусцой), отсюда прозвище для возницы или конюха.

Фамилия редкая, географически привязана к центральным и северным областям России. Встречается в старых переписях Вологодчины и Костромской губернии. Интересно, что однокоренные фамилии Трушин, Трушков, Трушкин — более частотны, а Трушагин стоит особняком из-за суффикса -аг-, который в русских фамилиях встречается нечасто (сравните: Бурлагин, Шушагин). Этот суффикс мог придавать прозвищу оттенок просторечия или ласкательности, как в слове «миляга».

Таким образом, Трушагин — фамилия, которая хранит в себе либо древнее имя-характеристику (суетливый, трясущийся), либо прозвище по погоде или занятию. Точного значения сейчас не восстановить, но ясно одно: предок носителя не был трусом в современном смысле слова.