Фамилия Трушковская — это отчество второго порядка, то есть она означает «внук Трушка» или «сын Трушкова». В основе лежит имя Трушко, которое служило просторечной, обиходной формой сразу двух канонических имен: Трифон (от древнегреческого tryphon — «нежный») и Трофим (в переводе — «кормилец» или «питомец»). Такое двойное происхождение не редкость: в народной среде имена, звучащие похоже, часто смешивались, и развести их теперь практически невозможно.

Скорее всего, основатель рода был человеком простого сословия. В крестьянской и посадской среде редко пользовались полными церковными именами, предпочитая короткие и привычные варианты вроде Трушка. От этого прозвищного имени сначала образовалось отчество Трушков — так называли сына Трушка. А уже от этого отчества, по модели «чей будешь?», возникла фамилия Трушковский. Суффикс -ский здесь указывает не на географическое происхождение (как у княжеских фамилий), а на принадлежность роду: Трушковский — потомок того самого Трушкова.

Интересно, что в русской ономастике фамилии на -ский в XVII–XIX веках часто присваивались духовенству и выходцам из малороссийских земель. Однако в случае с Трушковскими более вероятно, что фамилия возникла на западнорусских или украинских территориях, где суффикс -ский был распространен шире, чем в северной России. Впрочем, точную географию предков без генеалогических изысканий не установить.

Сама форма Трушко — типичный пример народной переработки имени: усечение основы и добавление ласкательного суффикса -ко, характерного для украинской и южнорусской традиции. Позже, когда фамилия уже закрепилась, она не менялась и передавалась по мужской линии, сохранив память о далеком предке, которого домашние звали просто Трушко.