Основой фамилии Трушковский послужило имя Трушко. Фамилия Трушковский произошла от имени Трушко, являющегося одним из вариантов канонического мужского личного имени Трифон, которое произошло от древнегреческого слова tryphon - «нежный», или имени Трофим, что в переводе означает «кормилец» либо «питомец». Скорее всего, основатель рода Трушковских был человеком из простого сословия. Фамилия Трушковский представляет собой отчество второго порядка: Трушковский — сын Трушкова и внук Трушка. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Трушко, со временем получил фамилию Трушковский.