Фамилия Трушкова происходит от канонического мужского имени Трифон, которое образовано от древнегреческого слова tryphon – нежный. В основу же фамилии легла просторечная украинская форма этого имени – Трушко. Трифон обратил ко Христу много язычников, за что после мучений за веру Христову был обезглавлен. Однако нельзя исключить, что в основе этой фамилии лежит прозвище, образованное от украинского слова «трушком» - «трусцой». Возможно, прозвище Трушко отражало манеру передвижения человека. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Трушко, со временем получил фамилию Трушкова.