Фамилия Трушутина — один из тех случаев, где на первый взгляд очевидная основа может обмануть. Самое простое и лежащее на поверхности объяснение — связать её с глаголом «трусить», то есть бояться, испытывать страх. Тогда прозвище Трушута (или Трус) дали бы человеку робкому, пугливому. Такие прозвища в крестьянской среде были распространены, но не стоит думать, что они всегда несли негативный оттенок — часто их давали «от обратного», как оберег, или же просто фиксировали заметную черту характера.

Однако более вероятно, что корень здесь не глагольный, а связанный с конкретным действием или предметом. В русских говорах слово «трусить» имело и другое, вполне «деловое» значение — трясти, сыпать, просеивать что-то сыпучее (зерно, муку). Трушутой могли прозвать мельника, который «трусит» муку, или крестьянина, занятого обмолотом зерна. В этом случае фамилия указывает не на качество характера, а на род занятий предка. Эта версия подкрепляется тем, что суффикс -ут- (как в словах «пасута», «плетюта») в русских прозвищах нередко образовывал имена деятеля.

Модель образования фамилии проста: к основе прозвища Трушута добавился патронимический суффикс -ин, указывающий на принадлежность («чей?» — сын Трушуты). Форма Трушутина — женский вариант, но в русской традиции фамилии на -ин склоняются по-разному в мужском и женском роде. Типологически фамилия Трушутина стоит в одном ряду с такими фамилиями, как Первутин, Скоробутина, Хромутов — все они образованы от прозвищ с уменьшительными или деятельными суффиксами.

Географически фамилия встречается преимущественно в центральных и северных областях России, что косвенно подтверждает «ремесленную» версию: в этих регионах было развито мукомольное дело и земледелие. Однозначно определить, от какого именно значения слова «трусить» пошла фамилия, без генеалогического исследования конкретной семьи невозможно. Но если выбирать между «бояться» и «просеивать», вторая версия выглядит основательнее: прозвище по профессии было более устойчивым и распространённым способом идентификации человека, чем прозвище по случайной черте характера.