Фамилия Трутченков образована от прозвища Трутко. По одной из версий, оно ведет свое начало от нарицательного «трут» - «род гриба, растущего на пнях». Вероятно, Трутком прозвали либо грибника, либо человека, рядом с домом которого росли подобные грибы. Возможно также, что прозвище Трутко этимологически связано с глаголом «трутить» - «жать, давить». Исходя из этого, можно предположить, что прозвище Трутко относится к числу «профессиональных» именований, содержащих указание на род деятельности основателя фамилии: он мог заниматься выжимкой подсолнечного или льняного масла. Со временем, вероятно, род Трутченко переехал в Россию, где и произошла русификация фамилии путем добавления суффикса -ов. Так и прозвище Трутко закрепилось за человеком в качестве наиболее употребительного именования, а со временем легло в основу фамилии Трутченков. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Трутко, со временем получил фамилию Трутченков.