Фамилия Трубченков образована от прозвища или мирского имени Трубка, Трубач или Трубченко. Основа здесь — «труба», но не в современном бытовом значении водопроводной трубы, а в старом: духовой музыкальный инструмент или печная труба. В русских говорах «трубкой» называли и часть самовара, и свёрнутый лист табака, и даже худого, длинного человека. Однако в основе фамилии скорее всего лежит профессиональное прозвище — трубач, то есть музыкант, игравший на трубе, или мастер, делавший трубы (печные, музыкальные). Суффикс -енков указывает на восточнославянскую, конкретно русскую модель происхождения: так образовывали фамилии от прозвищ на -енко, которые были типичны для южнорусских и украинских земель. Человека по прозвищу Трубченко (уменьшительное от Трубач или Трубка) его дети и внуки записывали как Трубченковы — «чей?» — «Трубченков сын».

Такая словообразовательная цепочка нередка: от прозвища на -ко (Трубченко) через притяжательный суффикс -ов получали фамилию. Аналоги: Козлов от Козел, Петров от Пётр, но здесь исходное — не имя, а прозвище. Фамилия Трубченков фиксируется в основном в центральных и южных регионах России, особенно в бывших Тульской, Рязанской, Курской губерниях — там, где было развито ремесло и охота, а также где в XVII–XVIII веках селились служилые люди, среди которых трубачи были в почёте. Встречаются и варианты написания — Трубчанков, Трубченинов, но Трубченков — самый распространённый.

В словарях русских фамилий (например, у Б. Унбегауна) фамилии на -енков рассматриваются как типично русские, хотя основа может иметь украинское происхождение. Это говорит о том, что предок носителя фамилии мог быть выходцем с Украины или из южнорусских земель, где прозвища на -енко были нормой. При переезде в великорусские губернии к прозвищу добавляли фамильный суффиск -ов, чтобы «обрусить» звучание. Таким образом, Трубченков — фамилия, в которой сплелись профессиональная характеристика предка (трубач или печник) и миграционная история его потомков.