Фамилия Цанндыкова — редкий случай, когда географическая привязка перевешивает все остальные версии. Она почти наверняка калмыцкого происхождения: характерный суффикс -ов(а) в русской передаче и основа, которая не имеет славянских или тюркских корней, указывают на бурятско-калмыцкую ономастику. Скорее всего, в основе лежит калмыцкое имя или прозвище Цанндык, где -дык — уменьшительный или ласкательный суффикс, а корень может восходить к словам со значением «чистый», «светлый» или к названию местности. В калмыцком языке есть слово «цаhан» — белый, чистый; от него образовано множество личных имён (Цаган, Цагандык). Фонетическая запись «Цанн» вместо «Цаhан» — следствие русской передачи, где гортанный звук выпал или упростился.

Фамилия образована по русской модели: к основе Цанндык добавили патронимический суффикс -ов, а женская форма Цанндыкова указывает, что носительница — женщина (мужской вариант — Цанндыков). Такая модель типична для фамилий калмыков и бурят, которые в XIX–XX веках фиксировались в документах с русскими окончаниями. Встречаемость фамилии крайне низкая: она почти не выходит за пределы Калмыкии и соседних регионов юга России. Если предки носили её, они могли быть скотоводами-кочевниками, получившими прозвище по имени или внешности, либо переселенцами, закрепившими родовое имя при переходе к оседлости.

Другие версии — например, связь с тюркским «цан» (колокол) или с немецкими корнями — выглядят натянутыми, так как суффикс -дык типичен именно для монгольских языков. Учитывая редкость фамилии, её носители, скорее всего, принадлежат к одной или нескольким родственным семьям, а не к разным этническим группам.