Фамилия Цилке звучит нехарактерно для русского уха. В ней нет привычных суффиксов -ов, -ин или -ский, а значит, перед нами не исконно русская фамилия, а западная, попавшая в русский обиход через переселение или ассимиляцию. Чаще всего такие фамилии встречаются у потомков немцев, латышей или эстонцев.

Корень «Цилк-» восходит к немецкому слову Zilke или Zilk, которое в свою очередь является уменьшительной формой от имени Целестин или, реже, от Цилли (Cilly). В восточно-прусских и прибалтийских говорах так могли называть человека небольшого роста или младшего в семье. В латышском языке есть слово cilks — «петля» или «завязка», но эта версия менее вероятна для фамилии: прозвища по ремеслу вязальщика или шорника в Прибалтике обычно оформлялись суффиксами, а не оставлялись в чистом виде.

Географически фамилия Цилке привязана к территории бывшей Восточной Пруссии (современная Калининградская область) и Латвии. После депортации немцев в 1945–1946 годах носители фамилии оказались в Германии, а в СССР остались единичные семьи, русифицировавшие написание. В метрических книгах XIX века фамилия встречается в Курляндской губернии — там её носили ремесленники и крестьяне-лютеране.

Обратите внимание на окончание: -е в русской передаче не склоняется по падежам, что типично для фамилий немецкого происхождения (сравните: Тильке, Вильке). В оригинале ударение падает на первый слог: Ци́лке. Если ваш предок носил эту фамилию, скорее всего, он был выходцем из немецких колонистов Прибалтики или потомком остзейских немцев, а сама фамилия изначально была прозвищем по имени или по внешности.