Фамилия Цишнати — редкий и яркий пример фамилии, которую можно разобрать, только заглянув в языки народов Кавказа и Закавказья. В русском языке у неё нет ни славянского корня, ни привычного суффикса -ов или -ин. Основа фамилии указывает на грузинское или, шире, кавказское происхождение.

Ключ к пониманию — окончание -швили, которое в грузинских фамилиях означает «сын» или «потомок» (ср. Джугашвили, Чхеидзе). Однако здесь мы видим форму Цишнати, где -и, скорее всего, является русским окончанием, адаптировавшим фамилию к местному склонению. Первоначальная грузинская форма, вероятно, звучала как Цишнашвили или Цишнатишвили. Со временем, при записи в российских документах, концовка могла редуцироваться до более краткого варианта.

Корень «цишна» (или «цишн») не является общеупотребительным в современном грузинском языке, но может восходить к древним основам. Одна из версий связывает его с тюркским или персидским словом, обозначающим «знак», «метку» или «пятно» (ср. перс. «чешм» — глаз, но в переносном смысле — «знак, родинка»). В таком случае прозвище Цишна мог получить человек с заметной родинкой или особой приметой. Другая, менее вероятная, гипотеза выводит корень из армянского или осетинского языков, где схожие звуки могли означать «маленький» или «тихий».

Географически фамилия Цишнати тяготеет к регионам исторической Грузии — Картли, Кахетии или Имеретии. В России она встречается крайне редко, и её носители, как правило, потомки переселенцев из Закавказья конца XIX — начала XX века. Сословная принадлежность предков могла быть любой: от крестьян до мелких дворян (азнаури), так как суффикс -швили не указывает на аристократическое происхождение (в отличие от -дзе или -ели).

Таким образом, фамилия Цишнати — это не случайный набор звуков, а сокращённая запись грузинской родовой метки. Её носитель с высокой вероятностью ведёт род из Грузии, а прозвище предка могло быть связано либо с внешним признаком, либо с местом жительства, которое со временем забылось.