Фамилия Цкуев — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. Если отбросить типичные русские суффиксы, в основе лежит корень «цку-», который в русском языке не встречается. Это сразу указывает на иноязычное происхождение, скорее всего, кавказское.

Самый вероятный вариант — фамилия тюркского или кавказского корня, адаптированная к русской модели. Суффикс «-ев» (а не «-ов») характерен для фамилий, образованных от основ, оканчивающихся на мягкий согласный или на «-й». В данном случае он прикрепился к основе «Цку(й)» или «Цку». Такая модель типична для фамилий, которые появились у народов Северного Кавказа, особенно у осетин, ингушей или чеченцев, при оформлении их в русских документах в XIX–XX веках.

В осетинском языке есть слово «цъыку» (или близкое по звучанию «цку») — так называли человека маленького роста, коротышку. Прозвище могло закрепиться за родоначальником. В ингушском и чеченском языках встречаются корни «цкъу» со значением «один» или «одинокий», но это менее вероятно, так как для прозвища «одинокий» — довольно абстрактная характеристика.

Фамилия Цкуев почти не встречается за пределами Кавказа. Основной ареал — Северная Осетия и Ингушетия. В осетинской среде она могла возникнуть как адаптация фамилии Цкуйты (осетинская патронимическая модель на «-ты»), которую при записи в метрические книги русифицировали в Цкуев. Если это так, то предки носителя фамилии — выходцы из горных районов Осетии, где прозвища по внешним признакам были обычным делом.

Других версий, например, связи с русским диалектным словом или с крестильным именем, нет — корень слишком специфичен. Фамилия не имеет отношения к еврейской или славянской среде. Таким образом, Цкуев — это фамилия, которая почти наверняка указывает на осетинские корни и на прозвище предка, связанное с малым ростом.