Фамилия Цыкалина — редкий случай, когда в основе лежит не имя и не профессия, а звукоподражательное прозвище. Суффикс -ин указывает на принадлежность: Цыкалина — «дочь (или жена) Цыкалы». Само прозвище Цыкала происходит от глагола «цыкать» — в русских говорах так называли звук, похожий на щелчок, цоканье или причмокивание. В ряде регионов «цыкать» означало «прищелкивать языком от досады, нетерпения» или «подзывать цыплят». Таким образом, Цыкалой могли прозвать человека с характерной манерой говорить, цокать при разговоре, либо того, кто постоянно покрикивал на домашнюю птицу.

В отличие от фамилий на -ов/-ев, форма на -ин чаще встречается в северных и центральных губерниях России — в Вологодской, Архангельской, Костромской областях. Именно оттуда, вероятно, и пошла фамилия Цыкалин. Интересно, что ударение в фамилии может падать как на первый слог (Цы́калина), так и на второй (Цыка́лина) — это зависит от местной диалектной традиции.

Родственные фамилии — Цыкалов, Цыкаловский, Цыкунов — образованы от того же корня, но с разными суффиксами. Если Цыкалов, скорее всего, южнорусский вариант (с суффиксом -ов), то Цыкалина сохраняет архаичную северную модель.

Встречается вариант написания через «и» — Цикалина, но он менее распространён и может быть результатом орфографической ошибки или украинского влияния. В целом фамилия редкая: в современных списках носителей насчитывается не более нескольких сотен человек, в основном в Центральной России и Поволжье.