Фамилия Цытыркина — женская форма фамилии Цытыркин, и её происхождение уводит нас в область редких, почти забытых прозвищ. В основе лежит слово «цытырка» или «цытырь» — диалектное название, которое в разных говорах могло означать либо нечто мелкое, дробное (сравните с «цыпка», «цыцка» — маленькое, крошечное), либо, по другой версии, относилось к человеку суетливому, непоседливому, «цытырящемуся» — то есть ерзающему, не находящему себе места. В любом случае, прозвище Цытырка давали либо очень маленькому человеку (возможно, ребенку или низкорослому взрослому), либо тому, кто отличался беспокойным нравом.

Словообразовательная модель здесь нестандартна. Суффикс -ин в фамилии Цытыркин указывает на принадлежность: «чей?» — сын Цытырки, то есть потомок человека с прозвищем Цытырка. Однако необычность в том, что основа «цытырк-» содержит редкий для русского именослова корень. В отличие от распространённых фамилий на -ин (Иванов — сын Ивана, Пушкин — сын Пушки), здесь прозвище само по себе имеет уменьшительно-пренебрежительный суффикс -к(а), что характерно для южнорусских и западнорусских говоров. Фамилия могла закрепиться в тех регионах, где бытовало слово «цытырка» — скорее всего, в курско-орловской или рязанской диалектной зоне.

Сравнение с однокоренными фамилиями подтверждает редкость корня. Встречаются Цыткин, Цытович, Цытульский — все они связаны либо с тем же значением «мелкий, маленький», либо с диалектным «цытать» (кричать, пищать). Но Цытыркин стоит особняком: двойной суффикс -ыр- + -к- делает его практически уникальным. В официальных источниках фамилия почти не фиксируется, что говорит о её локальном, возможно, даже односельском происхождении — носители могли быть выходцами из одной деревни или хутора.

Сословно предки Цытыркиных, скорее всего, относились к крестьянам или однодворцам. Прозвище не указывает на ремесло или должность, а описывает внешность или характер, что типично для низовых слоёв населения, где фамилии складывались из бытовых кличек. Никаких дворянских родов с такой фамилией не известно — это «народная» фамилия, сохранившая редкое диалектное слово, которое сегодня уже почти вышло из живого употребления.