Фамилия Тункерисов — редкая, даже уникальная. В ней сразу бросается в глаза необычное сочетание корня «Тункер» и фамильного суффикса «-исов». Такое окончание не характерно для русских фамилий, образованных от полных крестильных имён (там чаще встречается -ов/-ев или -ин). Суффикс «-исов» выдает фамилию как искусственную, скорее всего, семинарскую, то есть придуманную в духовном училище или семинарии для выходцев из духовного сословия.

Корень «Тункер» прямо отсылает к латинскому слову tunica (туника, одеяние). В церковной среде туникой называли длинную нижнюю рубаху, которую носили священнослужители. Семинаристам, особенно из семей причетников или дьячков, часто давали фамилии по названиям предметов облачения: Ризины (от риза), Стихарисов (от стихарь), Тункерисов — из того же ряда. Таким образом, основатель рода, по всей видимости, был человеком, имевшим отношение к церковной одежде: либо портным, шившим облачения, либо самим священником, а фамилию ему дали в учебном заведении по «профессиональному» прозвищу.

Вторая, менее вероятная версия — тюркское происхождение. В тюркских языках есть слово «тункер» или «тенкер» (ровный, равный, или же название лодки-долблёнки). Если бы фамилия была татарской или башкирской, она скорее выглядела бы как Тункеров или Тункерин. Окончание «-исов» — слишком сильный маркер семинарского, греко-латинского влияния, поэтому версия с латинской tunica гораздо убедительнее.

Географически фамилия встречается точечно, в основном в центральных областях России, а также среди потомков духовенства, рассеянных по Уралу и Сибири. Встретить Тункерисовых в деревне, где поколениями жили крестьяне, почти невозможно: это фамилия книжная, «учёная», закреплённая за одним родом выпускников духовных училищ XIX века. В дореволюционных метрических книгах её носители — псаломщики, дьяконы и священники, что подтверждает профессиональную привязку.