Фамилия Тункеева — женская форма от Тункеев, и её разбор стоит начать с суффикса. Формант -ев указывает на патронимическое происхождение: так называли по отцу. Основа Тункей — это, скорее всего, тюркское личное имя или прозвище. В тюркских языках корень «тун» (или «тюн») означает «ночь», а с уменьшительно-ласкательным аффиксом -кей получается имя вроде «Ночка» или «Тёмненький». Такие имена давали детям, родившимся ночью, или как оберег — чтобы злые духи не заметили ребёнка. Менее вероятна, но возможна связь с диалектным вариантом слова «тунгус» (устаревшее название эвенков), но тогда форма звучала бы скорее как Тунгусов.

Географически фамилия Тункеев/Тункеева тяготеет к Поволжью и Приуралью. Она встречается у татар, башкир, а также у русских, долго живших в смешанных регионах. В метрических книгах XIX века носители фамилии отмечены в Казанской, Уфимской и Оренбургской губерниях. Это объяснимо: именно здесь были распространены тюркские именования, которые позднее русифицировались через добавление суффикса -ев.

Прозвище или имя Тункей могло принадлежать человеку невысокого роста, смуглому или просто молчаливому (ср. тюркское «тун» — тихий, безмолвный). В любом случае, предок носителя фамилии был, скорее всего, крестьянином или мелким служилым человеком, а не дворянином — в родословные книги такие фамилии не вносились.

В написании стоит обратить внимание на двойное «е»: Тункеева, а не Тункева. Это говорит о том, что основа оканчивалась на -ей, а не на твёрдый согласный. Если бы исходное имя звучало как Тункей, то женская форма была бы Тункеева, что и закрепилось в документах.