Фамилия Тупис — редкий случай, где корень уводит нас не в славянские земли, а в диалекты балтийских языков. Основа «туп-» в русских говорах обычно связана со значением «тупой, неострый», но суффикс «-ис» здесь нетипичен для восточнославянских фамилий. В русской ономастике фамилии на «-ис» почти не встречаются, зато это характерный литовский суффикс, образующий прозвища (сравните с литовскими фамилиями вроде Купчис или Буткус). Скорее всего, перед нами литовская или жемайтийская фамилия, русифицированная при записи в документы Российской империи. Исходное литовское слово «tupis» могло означать «приседающий» или «сидящий на корточках» (от глагола «tūpti» — садиться, приседать). В переносном смысле так могли прозвать человека невысокого роста, который постоянно сидел на месте, или же того, кто работал сидя — например, сапожника или портного.

Второй, менее вероятный вариант — происхождение от польского «tupis» или «tupić», что значит «топать» или «сердито стучать ногами». В польских говорах так могли назвать вспыльчивого, шумного человека. Однако географически фамилия Тупис встречается в основном на северо-западе бывшей Российской империи — в Виленской, Ковенской, Гродненской губерниях, что подтверждает балтийскую версию.

Морфологически фамилия не получила типичного русского суффикса «-ов» или «-ин», что говорит о поздней фиксации: в XIX веке при переписях и метрикации литовские фамилии часто записывали в исходной форме, без адаптации. Поэтому Тупис — это не «сын Тупа» или «из рода Тупов», а прямое прозвище, закреплённое за конкретным человеком. Носители этой фамилии — потомки литовских или белорусских крестьян, ремесленников, возможно, мелкой шляхты, которая сохраняла местные говоры.

Известных исторических деятелей с этой фамилией нет, что типично для фамилий, не попавших в дворянские родословные книги. В современной России Тупис — редкая фамилия, встречающаяся в основном в Калининградской области и Псковщине, куда переселялись литовцы в советское время.