Фамилия Тышканхузова — тюркская по происхождению, и её разбор лучше начать с конца: суффикс -ов(-а) указывает на русскую модель образования фамилий, но основа явно заимствована. В данном случае перед нами женская форма, а мужской вариант — Тышканхузов. Фамилия редкая и составная: она образована от двух слов.

Первая часть — «тышкан». В тюркских языках (татарском, башкирском, казахском) слово «тышкан» означает «мышь». Это могло быть прозвищем: так могли назвать юркого, невысокого или тихого человека. Вторая часть — «хуз» или «хуза». Вероятнее всего, это искажённое «хузя» или «хужа» — «хозяин», «владелец», «господин» (от персидского «ходжа», через тюркские языки). Таким образом, исходное прозвище или имя могло звучать как «Тышканхузя» — «мышиный хозяин». Звучит необычно, но в тюркской ономастике встречаются составные имена из двух слов, где первое — характеристика, а второе — статус.

Менее правдоподобная версия: «хузова» — от тюркского «куз» (глаз) или «кузы» (ягнёнок), но тогда сочетание «тышканкуз» («мышиный глаз») выглядит натянутым и не встречается в известных словарях прозвищ.

По географии фамилия Тышканхузова тяготеет к регионам с татарским и башкирским населением — Татарстан, Башкортостан, Оренбургская область. Носители, скорее всего, были крестьянами или ремесленниками, а фамилия закрепилась в XIX веке, когда у тюркских народов начали массово оформлять фамилии по русским образцам. Уникальность фамилии в том, что она сохранила редкую двухосновную структуру, где зооморфное прозвище соединилось с социальным титулом — в русских фамилиях такое сочетание почти не встречается.