Фамилия Тюнеев образована от личного прозвища и относится к распространенному типу русских фамилий на -ев. В её основе лежит прозвище Тюней, которое восходит к диалектному нарицательному «тюней» — «лентяй», «шатун» или «тунеядец». Прозвище указывало на черты характера и поведение обладателя: так могли назвать человека праздного или того, кто бродит без дела. Суффикс -ев в фамилии указывает на патронимическую модель: Тюнеев — это «сын Тюнея», что типично для русских фамилий, закрепившихся в XV–XVII веках.

Существует и другая, менее правдоподобная версия, выводящая основу из нарицательного «тюни» — «тёплые сапоги». Тогда фамилию можно отнести к «профессиональным» именованиям, указывающим на род деятельности: предок мог заниматься пошивом или продажей обуви. Однако эта гипотеза слабее: диалектное «тюней» со значением «лентяй» встречается шире и лучше объясняет прозвищную логику, ведь насмешливые прозвища по характеру в русской среде были куда распространённее, чем редкие ремесленные термины. К тому же форма «тюни» во множественном числе для обозначения обуви менее типична для северных и центральных говоров, где закрепилась фамилия.

Потомок человека с прозвищем Тюней со временем получил фамилию Тюнеев. О точном месте и времени её возникновения говорить сложно: процесс формирования фамилий растянулся на столетия, а письменные источники по такой редкой фамилии скудны. Можно предположить, что фамилия бытовала в регионах с активным использованием диалектной лексики — вероятно, в Поволжье или на Русском Севере, где слово «тюней» фиксировалось в говорах. В любом случае, фамилия Тюнеев — живой памятник славянской письменности и культуры, сохранивший в себе отголосок народной речи и тех качеств, которые подмечали в человеке его соседи.