Фамилия Тютюнкова — женская форма от Тютюнков, а та в свою очередь образована от прозвища или нецерковного имени Тютюн. В основе лежит слово «тютюн» — так в южнорусских и украинских говорах называли табак. В словаре Владимира Даля «тютюн» зафиксирован именно в этом значении, с пометкой «южное» и «западное». Таким образом, фамилия Тютюнков — из числа «табачных»: предок мог быть торговцем табаком, курильщиком, а то и плантатором, если родом из мест, где табак выращивали.

Модель образования здесь простая и типичная для русских фамилий: суффикс -ов (в женском варианте -ова) присоединяется к основе Тютюн. В украинской традиции этот суффикс тоже распространён, так что фамилия могла сложиться и на украинской почве. Географически фамилия Тютюнков встречается в основном в регионах, где слово «тютюн» было в ходу: на юге России, в Белгородской, Воронежской, Ростовской областях, а также на востоке Украины. Встречаются и варианты Тютюненко, Тютюнник — они образованы от того же корня, но с другими суффиксами, характерными для украинской ономастики.

Версия, что фамилия могла произойти от тюркского слова «тютюн» в значении «дым», маловероятна для русской фамильной модели. Хотя в тюркских языках действительно есть слово tütün — «дым», в русских говорах закрепилось именно значение «табак», заимствованное через турецкое или крымскотатарское посредство. Поэтому для фамилии Тютюнков первична связь с табаком, а не с дымом как веществом.

В документах фамилия фиксируется с XVIII века. Например, в ревизских сказках Воронежской губернии встречаются крестьяне Тютюнковы — в основном однодворцы и государственные крестьяне. Дворянских родов с такой фамилией не известно, так что предки, скорее всего, были из податных сословий: крестьяне, мещане, казаки. Учитывая южное происхождение, немало Тютюнковых могло быть среди донских и кубанских казаков.

В современной России фамилия редкая, но не исчезающая. Носительница фамилии Тютюнкова может с уверенностью связывать свою родословную с южнорусскими или украинскими землями, а прозвище предка — с табачным промыслом или привычкой.