Фамилия Убеева — редкий случай, когда географический корень говорит громче, чем прозрачное прозвище. Скорее всего, в основе лежит топоним: река Уба в Восточном Казахстане (приток Иртыша) или одноимённые населённые пункты. Жителя с Убы называли «убеец», а его потомки получали фамилию Убеевы. Форма на -ев, а не на -ин, указывает, что основа оканчивалась на согласный или «й»: «убеец» → Убеев.

Менее вероятна, но возможна версия от тюркского личного имени Убай или Убей. В тюркских языках «уба» может означать «колдовство», «шаманство», а «убей» — «маленький», «младший». Тогда фамилия означала бы «сын Убая» или «сын младшего». Но для такой версии нет массовых подтверждений в документах: фамилия не частотна ни в Поволжье, ни на Кавказе, где тюркские имена распространены.

Суффикс -ев стандартен для русских фамилий, образованных от прозвищ или названий на -ец. Модель простая: географическое прозвище «убеец» (житель Убы) дало фамилию Убеев, а женская форма Убеева — это уже грамматический род.

Фамилия встречается в основном в Сибири и на Урале — в регионах, куда в XVII–XVIII веках ссылали или переселяли людей с Алтая и из казахских степей. Если у ваших предков были корни в Томской или Иркутской губернии, версия «от реки Уба» становится почти единственной.

В словарях русских фамилий (Унбегаун, Никонов) Убеева нет — она слишком локальна. Но именно эта редкость и делает её ценной для семейной истории: вы точно знаете, что предки не были массовыми переселенцами, а скорее всего, жили компактно в одном месте, которое и дало им имя.