Фамилия Убушеев — редкий пример фамилии калмыцкого происхождения, которая почти не встречается за пределами Калмыкии и соседних регионов. Её основа — личное имя Убуша, которое восходит к калмыцкому (ойратскому) слову «убушин» — «болезнь», «хворь». В традиционной культуре калмыков такие имена давали с охранительной целью: считалось, что имя, означающее нечто нездоровое или нежелательное, отпугнёт злых духов и отведёт настоящую болезнь от ребёнка. Это типичный пример «защитного» имени, распространённого у многих народов, где слабость или убожество в имени служили оберегом.

Словообразовательная модель проста: к имени Убуша добавлен притяжательный суффикс -ев, который в тюркских и монгольских языках выполняет ту же роль, что и русское -ов/-ев. Получается «Убушаев» — «сын Убуши», «принадлежащий Убуше». Форма Убушеев — это русифицированный вариант, где конечный гласный основы отпал (Убуш + -ев). В документах XIX–XX веков можно встретить и написание Убушаев, но современная норма закрепилась с одним «а» в середине.

Фамилия указывает на прямую связь с калмыцкой степной культурой, где до середины XX века сохранялась практика давать детям «отпугивающие» имена. Носители фамилии — потомки человека по имени Убуша, который, скорее всего, был простым скотоводом или воином, а не представителем знати (княжеские и духовные фамилии в Калмыкии образовывались иначе, часто через титулы или буддийские имена). Географически фамилия локализована в основном в Республике Калмыкия, изредка — в Астраханской области и Ставропольском крае.

В отличие от русских фамилий на -ов, которые массово появились после отмены крепостного права, калмыцкие фамилии в их русифицированной форме стали фиксироваться в метрических книгах и переписях лишь в XIX веке, когда буддийское население включили в общеимперский учёт. Поэтому Убушеевы — фамилия сравнительно поздняя по документальной фиксации, но с глубокими корнями в устной калмыцкой традиции.