Фамилия Ульяхунов — один из тех случаев, когда внешне тюркская основа скрывает за собой арабское имя с религиозным значением. Разбирать её стоит с финала: суффикс -ов указывает на русскую модель образования фамилий, а корень Ульяхун — это адаптированная на русской почве форма арабского имени Уллахун (Уллах). Имя Уллах, в свою очередь, восходит к арабскому «Улла» (высокий, возвышенный) или является вариантом имени «Аллах» с притяжательным окончанием, то есть «принадлежащий Аллаху». В тюркской среде, особенно у башкир и татар, такие имена с корнем «улла» были распространены как знак благочестия.

Вторая версия, менее вероятная, связывает фамилию с тюркским словом «улак» (козёл) или «улакчы» (погонщик лошадей), но тогда ожидалась бы форма Улаков или Улакчинов. Переход «л» в «ль» и появление «хун» не объясняются из тюркской лексики, зато хорошо ложатся на арабский корень. Поэтому большинство ономастов склоняются к тому, что Ульяхунов — это русифицированная форма патронима от имени Уллахун.

Географически фамилия редкая и привязана в основном к Башкортостану и соседним регионам Урала. Встречается среди башкир и татар-мишарей, что подтверждает её происхождение от мусульманского имени. Сословно предки Ульяхуновых, скорее всего, были из крестьян или служилых татар, так как в дворянские родословные книги эта фамилия не попала.

Интересная деталь: в некоторых записях XIX века фамилию писали через «ъ» — Ульяхуновъ, а в устной речи у старшего поколения башкир до сих пор можно услышать ударение на второй слог: Улья́хунов. Это указывает на то, что в исходном имени ударным был второй слог (Улла́х), а не первый, как в современном русском произношении.