Фамилия Устебаева образована от восточного прозвища Устебай, которое восходит к двум тюркским словам: «уста», что в переводе на русский язык означает «мастер, наставник» и «бай», то есть «богатый земледелец, скотовод или торговец». Вероятно, таким прозвищем наделяли опытного уважаемого человека, к которому люди приходили за советом. Процесс формирования фамилий был достаточно длительным, поэтому окончательно говорить о точном месте и времени возникновения рода Устебаевых можно лишь на основании генеалогических исследований.