Фамилия Ваакс — редкий для России случай фамилии, пришедшей из немецкого или прибалтийского культурного круга. Её основа — немецкое слово Wachs, что означает «воск». В немецкой ономастике такие фамилии чаще всего давали ремесленникам, работавшим с воском: свечникам, изготовителям восковых табличек, пчеловодам, продавцам воска. При этом в самой Германии фамилия распространена в написании Wachs, а форма Ваакс (с двойной «а») — это уже результат адаптации на русской почве, при передаче звучания латиницы кириллицей. Встречаются также варианты Вакс, Ваксман, что подкрепляет ремесленную версию.

Модель образования предельно проста: основа (прозвище или профессия) перешла в фамилию без типичных русских суффиксов -ов, -ин, -ский. Это указывает на то, что фамилия не славянская, а западноевропейская. Носители такой фамилии на территории Российской империи — это, скорее всего, потомки немецких колонистов, переселившихся в Поволжье, Причерноморье или Прибалтику в XVIII–XIX веках, либо остзейские немцы, служившие чиновниками или военными. Иногда фамилия могла быть записана у еврейского населения, так как в идише слово вакс (воск) также было в ходу, и фамилия могла возникнуть по тому же профессиональному принципу.

С точки зрения словообразования, фамилия стоит особняком: в ней нет привычных для русского уха суффиксов принадлежности. Это сразу выдаёт её иноязычное происхождение. Если сравнивать с однокоренными русскими фамилиями, то ближайшая параллель — Восков или Восковьев, где корень «воск» уже обработан славянскими суффиксами. Ваакс же сохранила исходный немецкий облик, лишь сменив алфавит.

Географически фамилия Ваакс сегодня встречается в России, Беларуси и странах Балтии, но остаётся крайне редкой. В дореволюционных метрических книгах и списках колонистов её можно найти у лютеранских общин. В советское время носители фамилии могли сменить написание на более привычное Вакс, поэтому архивные поиски стоит вести с учётом обоих вариантов.