Фамилия Вачейкина — женская форма фамилии Вачейкин, а та, в свою очередь, образована от мужского личного имени или прозвища Вачейка. В русской ономастике суффикс -к- в основе часто указывает на уменьшительно-ласкательную или обиходную форму, а суффикс -ин — на принадлежность: «чей сын?» — «Вачейкин», то есть сын Вачейки. В данном случае перед нами нестандартная модель: если обычные фамилии на -ин образуются от основ на -а/-я (Иван — Иванов, но Иванин — редко), то здесь исходная форма Вачейка дала Вачейкин, что встречается реже и может говорить о диалектном или устном происхождении.

Само имя Вачейка — это производное от канонического имени Вачеслав или, что вероятнее, от его народной формы Вачей. В славянской традиции имя Вачеслав (церковнославянская форма Вячеслава) сокращали до Вача, Вачей, а затем добавляли уменьшительный суффикс -ка, получая Вачейка. Таким образом, фамилия восходит к крестильному имени Вячеслав, которое означает «большая слава» или «наиславнейший». В быту такое прозвище могли дать человеку невысокого роста или младшему в семье — уменьшительная форма часто закреплялась за детьми или подмастерьями.

С точки зрения географии, фамилия Вачейкина (и Вачейкин) встречается в центральных и северных регионах России, особенно в бывших Владимирской, Костромской и Нижегородской губерниях. Там традиционно были распространены фамилии на -ин и -их, образованные от личных имён. В документах XVIII–XIX веков можно найти упоминания крестьян и мещан с такой фамилией — например, в ревизских сказках по Вязниковскому уезду. Сословно предки, скорее всего, были государственными или помещичьими крестьянами, реже — посадскими людьми.

Спорных версий происхождения немного. Иногда фамилию пытаются связать с диалектным словом «вачкать» (пачкать, марать) или «вачега» (рукавица), но это маловероятно: суффикс -ейка в прозвищах почти всегда указывает на личное имя, а не на предмет. Более правдоподобно, что Вачейка — это вариант имени Вася, Васечка, но такое объяснение хуже подтверждается историческими записями, где форма Вачей встречается именно как сокращение от Вачеслав. Так что основная версия — от крестильного имени Вячеслав через народную форму Вачейка — остаётся самой надёжной.