Фамилия Вачегина образована от прозвища Вачега. В старину в северных и центральных русских говорах вачегой называли рукавицу — либо вязаную шерстяную (варегу), либо суконную, иногда с кожаным верхом. Чаще всего это слово обозначало рабочую варежку. Прозвище Вачега могли дать человеку, который такие рукавицы изготавливал — значит, фамилия указывает на профессию предка.

Рукавицы известны на Руси с XIII века и были обязательной частью крестьянской одежды. Варежки делились на мужские и женские: женские — миниатюрнее, наряднее, с многоцветным узором; мужские — проще, без резинки, чтобы удобнее работать и легко скинуть с руки. Существовал старинный обычай: перед свадьбой невеста одаривала семью жениха узорными чулками и рукавицами, причём все изделия — с разными орнаментами, чтобы показать мастерство.

Суффикс -ин в фамилии Вачегина указывает на принадлежность: «чей?» — сын или дочь Вачеги. Такая модель типична для северных и центральных областей России. Географически фамилия чаще встречается в Вологодской, Архангельской и Кировской областях — там, где слово «вачега» бытовало в живой речи дольше всего.

В отличие от более распространённых «рукавичных» фамилий вроде Рукавишникова или Варёгина, фамилия Вачегина сохранила редкое диалектное слово, которое почти вышло из употребления. Это делает её ценным свидетельством местного говора и ремесленных традиций.