Фамилия Ваколя — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. В ней нет привычного для русского уха суффикса -ов или -ин, что сразу указывает: перед нами не типичная русская фамилия, а скорее украинская, белорусская или польская по модели образования. Окончание -я — характерный признак фамилий, образованных от прозвищ или имён в юго-западных землях бывшей Речи Посполитой.

Скорее всего, в основе лежит прозвище Ваколь. Что оно могло означать? Самая прямая версия — от глагола «вакать» или «вакнуть», который в южнорусских и украинских говорах означал «издавать невнятный звук», «мычать», «говорить невпопад». Прозвище Ваколя могли дать неразговорчивому, застенчивому человеку или, наоборот, тому, кто говорил нечленораздельно. В польском языке есть слово «wak» (крюк, багор), но для прозвища оно менее вероятно.

Менее распространённая, но возможная версия — связь с румынским или молдавским словом «vacă» (корова). В Бессарабии и на Буковине, где смешались восточнороманские и славянские элементы, фамилия Ваколя могла появиться как прозвище пастуха или владельца скота. Однако в украинском контексте корень «вак-» чаще связывают со звукоподражанием, чем с животноводством.

Суффикс -я (как в фамилиях Шевченя, Лисоволя) указывает на то, что фамилия закрепилась в форме прозвища без дополнительных патронимических суффиксов. Это характерно для западноукраинских и польских земель, где фамилии часто фиксировали в том виде, в каком человека называли в быту. Географически Ваколя, скорее всего, происходит из Волыни, Подолья или Галиции.

Сословного барьера у фамилии нет: её могли носить и крестьяне, и мещане. В дореволюционных метрических книгах эта фамилия встречается крайне редко, что говорит о её локальном распространении. Сегодня носители фамилии Ваколя живут в основном на западе Украины, а также среди потомков эмигрантов в Польше и Канаде.