Фамилия Вакщенко звучит необычно, и её редкость — первое, что бросается в глаза. В ней нет привычного для украинских фамилий суффикса -енко, который обычно стоит после корня на согласный (как в Шевченко или Коваленко). Здесь же мы видим сочетание -щенко, что указывает на более сложную словообразовательную цепочку. Скорее всего, в основе лежит не имя или профессия напрямую, а прозвище или уменьшительная форма, которая затем обросла суффиксами.

Наиболее вероятная версия: фамилия образована от прозвища Вакша или Вакш. В старых русских говорах «вакша» — это белка, а также ловкий, подвижный человек. В некоторых диалектах слово «вакша» означало «крикун», «горлопан». От основы Вакш- с помощью уменьшительного суффикса -к- (Вакш-ко) и последующего патронимического -енко получилась форма Вакщенко. То есть фамилия могла означать «сын Вакши» или «потомок человека по прозвищу Вакша». Ударение, скорее всего, падает на первый слог: Ва́кщенко.

Менее вероятна, но возможна связь с глаголом «вакшить» — в некоторых говорах это «медлить», «бездельничать» или, наоборот, «суетиться». Такое прозвище могли дать человеку с определённым складом характера. Географически фамилия редкая, встречается в основном на юге России и востоке Украины, что типично для фамилий на -енко, но с нестандартным корнем.

В отличие от массовых фамилий вроде Коваленко, Вакщенко не связана с очевидным ремеслом или крестильным именем. Это фамилия-загадка, где основное значение кроется в забытом диалектном слове. Носитель такой фамилии может смело считать, что его предок был либо человеком прытким, как белка, либо обладал громким голосом — в зависимости от того, какое значение слова «вакша» было в ходу в его родных местах.