Фамилия Валдуев — одна из тех, где ясна модель образования, но основа вызывает споры. Типичный русский суффикс -ев указывает на происхождение от прозвища или имени, оканчивающегося на -уй (в родительном падеже — Валдуя), то есть «сын Валдуя» или «человек из рода Валдуя». Здесь важно не путать с отчествами от канонических имён: в основе лежит не крестильное имя, а мирское прозвище.

Самая вероятная версия связывает корень «валд-» с диалектным словом «валдай» или «валдуй». В северных и центральных говорах «валдай» — это шум, гам, суматоха, а также болтун, пустомеля. В словаре Владимира Даля «валдай» прямо отмечен как «крикун, горлопан». Таким образом, Валдуем могли прозвать человека шумного, говорливого или суетливого. Фамилия образована от этого прозвища по стандартной модели, как, например, Болтунов или Крикунов.

Есть и более редкая гипотеза — о связи с финно-угорскими корнями. В карельском и вепсском языках есть слово «valdu» (власть, сила) или «valdai» (господин). Учитывая, что фамилия Валдуев встречается в регионах Русского Севера и Приуралья, где исторически был контакт с финно-угорскими народами, не исключено, что прозвище могло возникнуть на стыке языков. Однако эта версия менее убедительна: русская словообразовательная модель с суффиксом -ев и отсутствие прямых заимствований в документах делают «шумную» версию основной.

Встречается фамилия в основном в северных областях России — Архангельской, Вологодской, а также в Пермском крае. Это подтверждает её диалектное происхождение. Валдуевы, скорее всего, были крестьянами или посадскими людьми, получившими фамилию по уличному прозвищу предка. Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано. В написании возможны варианты Валдуев и Валдуев (с ударением на второй слог), но в официальных документах закрепилась первая форма.