Фамилия Ванеков — редкий случай, когда модель образования перевешивает смысл корня. Она построена по схеме «отчество + притяжательный суффикс -ов», но исходное имя стоит в необычной форме.

Основа — Ванек. Это уменьшительная форма от Иван, но не через стандартный суффикс -к- (Ванька), а с другим оттенком: Ванек — скорее ласкательное или полуофициальное прозвище, которое бытовало в некоторых говорах. Фамилии от полного Ивана (Иванов, Иваньков) встречаются на каждом шагу, а Ванеков закрепил именно ту форму, которую в быту использовали для обращения к человеку по имени, но с особым, «своим» оттенком близости.

Географически фамилия тяготеет к южнорусским и украинским землям, где окончание -ек в уменьшительных именах было распространено шире, чем в центральных областях. Встречается она редко, и это не случайность: модель «Ванек + -ов» конкурировала с более привычной «Ванька + -ин» (Ванькин). Победила вторая, а Ванеков остался локальным вариантом.

Интересно, что фамилия могла возникнуть не от имени, а от прозвища Ванек, которое давали человеку, похожему на Ивана по характеру или внешности, но не носившему этого имени. В крестьянской среде так могли назвать и старшего сына, и работника, которого считали «своим», домашним Иваном. Но первая версия — от уменьшительного имени — всё же правдоподобнее: она проще и типичнее для русской ономастики.

Суффикс -ов указывает на принадлежность: Ванеков буквально значит «сын Ванека» или «из рода Ванека». Никакого тайного смысла, никакого ремесла или сословия за фамилией не стоит. Это чистое отчество, которое со временем застыло и перестало быть прозрачным. Носитель фамилии Ванеков — потомок человека, которого в быту звали не Иваном и не Ванькой, а именно Ванеком.