Фамилия Ванеркина женская, её мужской вариант — Ванеркин. Редкая, с прозрачной, на первый взгляд, основой, которая на деле ставит перед исследователем несколько загадок. В русских фамилиях суффикс -ин обычно указывает на принадлежность: «чей?» — Ванеркин, то есть сын или потомок Ванера. Но что такое «Ванер»?

Самая вероятная версия — это фонетическое искажение немецкой фамилии Ваннер (Wanner) или Ванер (Waner). Немецкое Wanner означает «веяльщик» или «тот, кто веет зерно» (от глагола wannen — веять). В XVIII–XIX веках в Россию приглашали множество немецких колонистов, ремесленников и специалистов. Их фамилии на слух русифицировались: утрачивали двойные согласные, меняли окончания. Так Wanner мог превратиться в Ванер, а затем, по русской модели, дать фамилию Ванеркин («сын Ванера»). Это объясняет и редкость фамилии: она привязана к конкретным волнам переселения, а не к массовому крестьянскому прозвищу.

Вторая версия, менее убедительная, но возможная для южных регионов, — связь с тюркским корнем «ван» (большой, знатный) или диалектным русским «ванер» (вальяжный, медлительный человек). Однако для таких гипотез нет устойчивой документальной базы, и они не объясняют характерный суффикс -кин, который в русской среде чаще присоединяется к именам собственным (Ванька — Ванин, Ванер — Ванеркин), а не к нарицательным прозвищам.

Географически фамилия Ванеркина встречается точечно, преимущественно в Поволжье и на Урале — регионах активного расселения немецких колонистов. В дореволюционных метрических книгах её носители могли числиться мещанами или государственными крестьянами, но не дворянами. Таким образом, Ванеркина — это, скорее всего, «немецкий след» в русской ономастике: фамилия ремесленника-веяльщика, обрусевшая и закрепившаяся в потомстве.