Фамилия Ванесян — типичный пример армянской родовой фамилии, образованной от мужского личного имени. В основе лежит имя Ванес, которое имеет два основных толкования. Согласно первому, с армянского оно переводится как «огненный». Вторая версия связывает Ванес с древнееврейским именем Иоанн, что значит «милость Божья».

Фамилию построили по стандартной армянской модели с патронимическим суффиксом -ян. Этот суффикс, как и его более старая форма -янц, восходит к значению «из рода» или «из семьи». Таким образом, исходный смысл фамилии Ванесян — «из рода Ванеса». В армянской ономастике такие фамилии называют «азганун» — слово, которое буквально обозначает «имя клана» или «родовое имя».

Интересно, что суффикс -ян стал массово закрепляться в армянских фамилиях относительно поздно, в основном в XIX веке, когда на территории Российской империи проводилась унификация фамилий для целей переписи и налогообложения. До этого родовые имена могли передаваться без постоянного суффикса или с окончанием -янц. Поэтому фамилия Ванесян, как и многие другие, в современной форме — продукт сравнительно недавней фиксации, хотя само имя Ванес бытует в армянской среде столетиями.