Фамилия Вансию — редкий случай, когда написание почти полностью совпадает с произношением, но при этом остаётся загадочным по происхождению. В ней нет привычных русских фамильных суффиксов -ов, -ин или -ский, что сразу настораживает: перед нами либо поздняя искусственная фамилия, либо иноязычное заимствование, адаптированное кириллицей.

Скорее всего, основа «Вансий» или «Вансия» восходит к личному имени. В русской традиции так могли записать грузинское или молдавское имя Вансия (уменьшительное от Иван, через западнорусское «Вань» с окончанием -ия). В таком случае фамилия образована по модели, характерной для юго-западных регионов Российской империи (Бессарабия, Малороссия), где финаль -ий/-ию не редкость. Другой вариант — фамилия могла возникнуть из прозвища Ванся (от «ванька» — простофиля, но в ироничном, а не обидном смысле), а окончание -ю указывает на украинское или белорусское влияние, где так закрепляли прозвища в речи.

Спорный, но возможный путь — искусственное происхождение в среде духовенства. Семинаристы нередко получали фамилии из латинских или греческих слов. Если допустить, что «Вансию» — искажённое Vanitas (суета, тщета) или Vansio (от vanescere — исчезать), то это редкий случай латинизированной фамилии, переосмысленной на русской почве. Однако прямых подтверждений такой версии в словарях нет, и она уступает по правдоподобию версии с личным именем.

Географически фамилия Вансию встречается единично, преимущественно в записях XIX — начала XX века на территории современной Украины и Молдовы. Носители, скорее всего, были крестьянами или мещанами, а сама фамилия закрепилась в документах при паспортизации, когда редкое имя или прозвище записали как есть, без переделки в стандартную форму.