Фамилия Варгузов — редкий случай, когда прозвище, скорее всего, связано с диалектным словом, а не с крестильным именем. Основа «варгуз» или «варгуза» в русских говорах означала беспокойного, крикливого человека, непоседу или ворчуна. В словаре Даля можно найти слово «варганить» — делать шум, греметь, а также «варгун» как синоним ворчуна или брюзги. Вероятно, предок получил такое прозвище за шумный нрав или привычку громко спорить.

Суффикс «-ов» указывает на стандартную русскую модель образования фамилий: «чей сын?» — Варгузов, то есть сын Варгуза. Фамилия не дворянская и не семинарская, а типично крестьянская или посадская. По географии бытования Варгузовы встречаются в основном в центральных и северных областях России, где диалектная лексика была особенно богата. Встречается также вариант Варгузин, но с суффиксом «-ин» он образован от той же основы, но по модели «чей?» — сын Варгузи.

Сравнение с однокоренными фамилиями — Варганов, Варгин — показывает, что все они восходят к одному гнезду слов, связанных с шумом, ворчанием или работой (варганить). Но Варгузов стоит особняком: если Варганов мог произойти от музыкального инструмента варгана (губной гармошки), то Варгузов — от личностной характеристики. Спорных версий немного: некоторые любители экзотики пытаются связать фамилию с финно-угорским корнем, но убедительных лингвистических обоснований этому нет. Правдоподобнее всего — исконно русское прозвище, которое закрепилось за родом.