Фамилия Вашкинцев выделяется даже на фоне русского фамильного разнообразия: её суффикс -ев при основе на -ин- создаёт редкую двойную модель. Обычно фамилии на -ин образуются от основ на -а/-я (Петин, Ильин), а на -ов/-ев — от основ на согласный или -о (Петров, Иванов). Здесь же мы видим «Вашкин» + «-цев», что буквально означает «сын Вашкина» или «потомок Вашкина». Такая конструкция — почти всегда признак того, что фамилия сложилась не из прямого прозвища, а из патронима (отчества) или названия по владельцу: «чей будешь?» — «Вашкинцев», то есть из семьи Вашкиных.

Основа «Вашка» — это уменьшительная форма от крестильного имени Василий. В русском языке имя Василий дало десятки производных: Вася, Васюта, Васятка, Вашура, а также Вашка. Форма с суффиксом -к- характерна для северных и центральных говоров, где «Вашка» звучало как обычное обиходное имя, без пренебрежения. Соответственно, прозвище Вашка мог получить либо сам Василий, либо его отец, которого в быту называли по сыну.

Географически фамилия Вашкинцев тяготеет к Вятке и Пермскому краю — регионам, где фамилии с суффиксом -ев при двойной основе встречаются чаще, чем в среднерусских областях. В переписных книгах XVII–XVIII веков на Вятке фиксируются крестьяне и посадские люди с фамилиями Вашкин и Вашкинцев, что указывает на устойчивую ономастическую традицию в этих местах. Сословно носители, скорее всего, были государственными или монастырскими крестьянами, реже — мещанами.

В ономастических справочниках эта фамилия не относится к числу частотных, но и не является единичной. Её редкость связана именно с нестандартной словообразовательной цепочкой: чтобы возник «Вашкинцев», нужно было сначала закрепиться патрониму Вашкин, а затем — произвести от него следующую ступень. В большинстве регионов Руси такие двухступенчатые формы быстро упрощались, но на Вятке и в Прикамье они сохранялись дольше из-за более медленного течения миграционных процессов.

Других версий происхождения, например от топонима Вашкино или от прозвища «вашка» (предположительно из диалектного «вашкий» — неуклюжий), можно рассматривать, но они менее убедительны: ни один известный населённый пункт с таким названием не дал массовой фамилии, а диалектное слово «вашка» не зафиксировано в словарях русских говоров как распространённое прозвище. Так что наиболее вероятный путь — через имя Василий и его уменьшительную форму.