Фамилия Ватинян — яркий пример армянской модели фамилии, образованной с помощью суффикса -ян. Это один из самых распространённых фамильных суффиксов в Армении, указывающий на принадлежность к роду, происхождение от предка. Дословно Ватинян означает «из рода Ватиня» или «потомок Ватиня».

Основа фамилии — личное имя или прозвище Ватин. Скорее всего, это вариант армянского мужского имени Ват (Vat), которое в свою очередь может восходить к древнеперсидскому или авестийскому корню со значением «ветер», «воздух». В армянской ономастике такие имена, связанные со стихиями, не редкость. Менее вероятна, но возможна связь с тюркским словом «ват» (в значении «шум», «крик») — в таком случае прозвище могли дать человеку с громким голосом или беспокойным характером.

Географически фамилия Ватинян тяготеет к историческим армянским областям, особенно к Западной Армении (территория современной восточной Турции). После геноцида армян 1915 года носители фамилии расселились по диаспоре: в России, США, Франции, Ливане. Встречаются варианты написания: Ватинян, Ватиан, а также русифицированная форма Ватинов (по модели русских фамилий на -ов).

Суффикс -ян в армянских фамилиях — аналог русского -ов/-ев или грузинского -дзе. Он не указывает на социальный статус предка: Ватинянами могли быть и крестьяне, и ремесленники, и священники. Главное, что объединяет носителей фамилии, — общий предок по имени Ватин, живший, вероятно, несколько веков назад.