Фамилия Ватютов — одна из тех, где ясна модель образования, но неочевидна основа. Суффикс -ов указывает на принадлежность: Ватютов — это сын или потомок человека по имени или прозвищу Ватют. Само слово «Ватют» в современном русском языке не встречается, поэтому ключ к разгадке — в диалектах и старых формах личных имён.

Скорее всего, в основе лежит вариант крестильного имени Ватютя — одной из народных, «домашних» форм канонического имени Ват (редкого, но фиксируемого в святцах) или, что вероятнее, имени Ват — уменьшительного от Вадим, Валентин или даже Иван (в говорах «Ваня» могло звучать как «Ватя»). Такой путь типичен для русских фамилий: полное имя сокращали до двух-трёх слогов, добавляли суффикс -ют- (Ватютя), а затем — фамильный -ов. Суффикс -ют- в данном случае придаёт оттенок ласкательности или принадлежности к младшему поколению (сравните: Мишутка, Ванюта).

Другая, менее вероятная версия выводит фамилию из прозвища. В южнорусских говорах слово «ватютя» могло означать медлительного, нерасторопного человека (от глагола «валять», «ватулить» — мять, мешкать). Однако в этом случае фамилия скорее имела бы форму Ватютин (от основы «ватютя»), а не Ватютов. Форма на -ов настойчиво указывает на имя собственное, а не на нарицательное прозвище.

Географически фамилия редкая, встречается в основном в центральных и южных областях России (Воронежская, Ростовская области), что косвенно поддерживает версию о народной форме имени, бытовавшей именно в этих говорах. Среди однокоренных — фамилии Ватютин, Ватутин, Ватуев. Все они, скорее всего, восходят к одному корню — уменьшительным формам от Вадим, Валентин или реже — от Ват.

Таким образом, предок носителя фамилии Ватютов, по всей видимости, звался в быту Ватютя — уменьшительно-ласкательно от крестильного имени. Никакого отношения к ремеслу или социальному статусу эта фамилия не имеет, она чисто «именная», что для русского ономастикона XVII–XIX веков — самый распространённый случай.