Фамилия Ваймер (в немецком написании Weimer) образована от аналогичного личного имени, которое восходит к двум германским основам: wini - «друг» или wīg - «сражение, битва» и mār - «известный, знаменитый». Таким образом, имя Ваймер означает «известный друг» или «знаменитый (отличившийся) в сражении». По другой версии, фамилия Ваймер представляет собой фонетический вариант фамилии Веймар (Weimar) и образована по названию города Веймара, выходцем из которого был основатель рода Ваймер.