Фамилия Вайтекунас образована от белорусского прозвища Вайтекун, которое ведет свое начало от слова «войт», заимствованного из немецкого языка. Исходя из этого, можно предположить, что прозвище Вайтекун относится к так называемым «профессиональным» именованиям, содержащим указание на род деятельности человека.