Фамилия Ведункина — женская форма фамилии Ведункин. Её основа сразу наводит на мысль о древнерусском «ведун» — колдун, знахарь, человек, владеющий тайными знаниями. Однако, как часто бывает в ономастике, прямое значение не всегда совпадает с реальным происхождением прозвища. Слово «ведун» в старину было не только пугающим, но и уважительным: так называли мудрецов, лекарей, хранителей родовой памяти. Вряд ли предок Ведункиных был колдуном в современном сказочном смысле — скорее, он мог быть знахарем, костоправом или просто человеком, к чьим советам прислушивались.

Словообразовательная модель фамилии стандартна для русского севера и центральных областей. Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей сын?» — Ведункин, то есть сын Ведуна. Фамилия образована от личного прозвища или нецерковного имени Ведун. Такие имена-прозвища были распространены на Руси до XVII века, особенно в крестьянской и посадской среде. Интересно, что фамилия не получила суффикса -ов (Ведунков), что говорит о её более архаичном, возможно, северном происхождении: в новгородских и вятских землях -ин было продуктивнее, чем -ов.

По данным современных исследований, фамилия Ведункин (и Ведункина) встречается нечасто. Основной ареал — Вологодская, Архангельская области и Пермский край. Это совпадает с зоной бытования диалектного слова «ведун» в значении «колдун, знахарь». В южных и западных регионах России фамилия почти не фиксируется. Стоит заметить, что в некоторых говорах «ведун» могло быть ироничным прозвищем для хитрого, изворотливого человека — так что не исключено, что прозвище дали не за ремесло, а за характер.

Учитывая редкость фамилии, можно предположить, что род Ведункиных не был многочисленным и разветвлённым. В дореволюционных переписях носители фамилии числились в основном государственными крестьянами, реже — мещанами. Дворянских корней у неё нет: фамилия сугубо народная, простонародная, без книжной или церковной окраски. В современной России фамилия сохраняется, но остаётся малораспространённой, что делает её хорошим маркером для генеалогического поиска именно в северных регионах.