Вероятно, фамилия Вегенер — вариант фамилии Вагнер. Она образована от немецкого нарицательного Wagner, которое в переводе на русский язык означает «мастер по изготовлению карет». Таким образом, прозвище Вегенер, легшее в основу данной фамилии, относится к так называемым «профессиональным» именованиям, указывающим на род деятельности человека.